Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms