Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms