Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms