Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb4Q02738 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms