Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms