Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnb1Q02248 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms