Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Snai1Q02085 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms