Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RykQ01887 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RykQ01887 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RykQ01887 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RykQ01887 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RykQ01887 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RykQ01887 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RykQ01887 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RykQ01887 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RykQ01887 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RykQ01887 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RykQ01887 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RykQ01887 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RykQ01887 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms