Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1cQ01815 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms