Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms