Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms