Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms