Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms