Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SelpQ01102 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelpQ01102 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms