Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp4Q00724 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms