Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IhhP97812 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IhhP97812 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IhhP97812 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IhhP97812 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IhhP97812 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IhhP97812 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IhhP97812 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IhhP97812 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IhhP97812 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IhhP97812 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IhhP97812 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IhhP97812 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IhhP97812 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IhhP97812 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IhhP97812 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IhhP97812 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IhhP97812 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IhhP97812 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IhhP97812 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IhhP97812 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IhhP97812 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IhhP97812 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IhhP97812 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IhhP97812 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IhhP97812 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IhhP97812 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IhhP97812 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms