Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AlkP97793 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AlkP97793 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlkP97793 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlkP97793 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlkP97793 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlkP97793 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlkP97793 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlkP97793 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlkP97793 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlkP97793 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlkP97793 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlkP97793 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlkP97793 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlkP97793 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlkP97793 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlkP97793 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlkP97793 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlkP97793 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlkP97793 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlkP97793 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlkP97793 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlkP97793 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlkP97793 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlkP97793 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlkP97793 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AlkP97793 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms