Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmklr1P97468 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms