Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smyd1P97443 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms