Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lig3P97386 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig3P97386 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms