Protein–RNA interactions for Protein: P97382

Kcnab3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab3P97382 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnab3P97382 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnab3P97382 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms