Protein–RNA interactions for Protein: P97360

Etv6, Transcription factor ETV6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv6P97360 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv6P97360 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Etv6P97360 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms