Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Taf1bP97358 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms