Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SmsP97355 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmsP97355 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmsP97355 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmsP97355 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmsP97355 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SmsP97355 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmsP97355 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmsP97355 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmsP97355 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmsP97355 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmsP97355 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmsP97355 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmsP97355 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SmsP97355 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SmsP97355 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SmsP97355 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SmsP97355 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SmsP97355 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SmsP97355 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SmsP97355 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SmsP97355 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SmsP97355 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SmsP97355 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SmsP97355 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmsP97355 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SmsP97355 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmsP97355 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmsP97355 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmsP97355 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmsP97355 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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