Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms