Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ptprn2P80560 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprn2P80560 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprn2P80560 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprn2P80560 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprn2P80560 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprn2P80560 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprn2P80560 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprn2P80560 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprn2P80560 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprn2P80560 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms