Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Q6P79568 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms