Protein–RNA interactions for Protein: P70697

Urod, Uroporphyrinogen decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrodP70697 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UrodP70697 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UrodP70697 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UrodP70697 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UrodP70697 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UrodP70697 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UrodP70697 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UrodP70697 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UrodP70697 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UrodP70697 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UrodP70697 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms