Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf3P70671 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf3P70671 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf3P70671 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf3P70671 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms