Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shox2P70390 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shox2P70390 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms