Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx3P70354 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms