Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms