Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn1P70268 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkn1P70268 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkn1P70268 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkn1P70268 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkn1P70268 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn1P70268 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn1P70268 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn1P70268 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms