Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig1P70193 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms