Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkacbP68181 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkacbP68181 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkacbP68181 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkacbP68181 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkacbP68181 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkacbP68181 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkacbP68181 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkacbP68181 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkacbP68181 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkacbP68181 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkacbP68181 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkacbP68181 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkacbP68181 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkacbP68181 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkacbP68181 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PrkacbP68181 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PrkacbP68181 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkacbP68181 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkacbP68181 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkacbP68181 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkacbP68181 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkacbP68181 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkacbP68181 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkacbP68181 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkacbP68181 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PrkacbP68181 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkacbP68181 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkacbP68181 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkacbP68181 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkacbP68181 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkacbP68181 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkacbP68181 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkacbP68181 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkacbP68181 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkacbP68181 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkacbP68181 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms