Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Acta1P68134 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms