Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SnrpnP63163 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpnP63163 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms