Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps3P62908 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps3P62908 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps3P62908 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps3P62908 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms