Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d2P62838 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d2P62838 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms