Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpcal1P62748 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hpcal1P62748 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms