Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SnrpfP62307 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpfP62307 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms