Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap1s1P61967 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap1s1P61967 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms