Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2kP61087 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2kP61087 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms