Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr3bP59470 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3bP59470 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms