Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scarf2P59222 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scarf2P59222 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms