Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdrg1P59048 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms