Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Paxbp1P58501 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Paxbp1P58501 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms