Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ctdsp1P58466 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ctdsp1P58466 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Ctdsp1P58466 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctdsp1P58466 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctdsp1P58466 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctdsp1P58466 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctdsp1P58466 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctdsp1P58466 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ctdsp1P58466 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ctdsp1P58466 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ctdsp1P58466 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ctdsp1P58466 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ctdsp1P58466 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ctdsp1P58466 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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