Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm9sf2P58021 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms