Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms